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基于SOPC的低電壓電泳芯片系統(tǒng)平臺設(shè)計

作者: 時間:2009-05-12 來源:網(wǎng)絡(luò) 收藏

  如圖1所示,在一片CyclonII 2C35 FPGA中,采用 Builder構(gòu)建主從雙CPU架構(gòu)的,其中CPU1作主控,負責電泳信號的數(shù)據(jù)采集、處理及任務(wù)分配;CPU2作協(xié)處理,負責進樣控制電路、分離電壓控制。主控CPU1采集電泳信號后,將部分數(shù)據(jù),如是進樣還是分離、是否結(jié)束、電壓是否施加到下一電極對等標志發(fā)送給從CPU2處理, 然后由CPU2再控制相應(yīng)地控制電路,最終實現(xiàn)電極施加電壓位置與待分離組分運動范圍保持一致。這種結(jié)構(gòu)由于CPU1和CPU2各自控制一部分電路模塊,且主、從CPU交換的數(shù)據(jù)較少,有利于保障整個的高速采集與控制處理。主從CPU之間數(shù)據(jù)交換通過內(nèi)嵌的雙口RAM來實現(xiàn)。若主、從CPU數(shù)據(jù)交換多且頻繁,一般不采用此種主從結(jié)構(gòu)[6-7],可采用流水線結(jié)構(gòu),無論怎樣的架構(gòu),都可在不改變硬件的條件下,通過軟件更新就可實現(xiàn)雙CPU架構(gòu)的改變。

  4 系統(tǒng)軟件的設(shè)計

  本系統(tǒng)的軟件設(shè)計,主要包括:基于 Builder定制的運動控制模塊設(shè)計,基于Avalon流模式電泳信號采集IP核設(shè)計,負壓進樣控制模塊設(shè)計、片上系統(tǒng)集成開發(fā)軟件設(shè)計、片上系統(tǒng)與PC機之間的通訊設(shè)計以及上位機電泳譜分析分析軟件等組成。其中,上位機開發(fā)軟件為C++ Builder。由于篇幅有限,本文僅給出運動控制控制流程圖以及毛細管采集與控制軟件結(jié)構(gòu)圖,分別見圖5,圖6所示。

低電壓運動控制流程圖 圖6 毛細管電泳芯片采集與控制軟件結(jié)構(gòu)圖

圖5 低電壓運動控制流程圖

毛細管電泳芯片采集與控制軟件結(jié)構(gòu)圖

圖6 毛細管采集與控制軟件結(jié)構(gòu)圖

  5 結(jié) 論

  本文提出了一種基于的低電壓毛細管電泳芯片采集與控制的實現(xiàn)方法。通過在Altera的CyclonII FPGA中利用SOPC Builder庫中的NiosII軟核處理器,基本IP核以及自定制IP核,能靈活快速地搭建真正意義上屬于自己的采集與控制SOPC系統(tǒng),縮短開發(fā)周期;通過內(nèi)嵌于FPGA內(nèi)部的NIOSII軟核處理器,能靈活方便地實現(xiàn)多處理器并行處理結(jié)構(gòu),保證系統(tǒng)高速處理;采用單芯片實現(xiàn)片上系統(tǒng)使系統(tǒng)解決方案更可靠、更廉價、更簡潔;通過定制指令,利用FPGA多個并行處理單元, 使得在某些方面的處理能力大大超過硬核處理器,如DSP處理器;該方案由于采用SOPC技術(shù)能通過軟件的不斷更新實現(xiàn)系統(tǒng)硬件以及軟件的升級與換代。

  本文作者的創(chuàng)新點:將SOPC技術(shù)應(yīng)用于生物芯片的控制與檢測,在硬件不變的條件下,通過軟件更新就可對整個系統(tǒng)進行升級換代,特別適合生物芯片技術(shù)前期開發(fā)以及探索性研究。


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