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AI系統(tǒng)可以加速癌癥發(fā)現(xiàn)的搜索

作者: 時間:2018-11-30 來源:網(wǎng)絡(luò) 收藏

  該系統(tǒng)名為LION LBD,由劍橋大學(xué)的計算機(jī)科學(xué)家和癌癥研究人員開發(fā),旨在幫助科學(xué)家尋找癌癥相關(guān)的發(fā)現(xiàn)。它是第一個旨在支持癌癥研究的基于文獻(xiàn)的發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)。結(jié)果發(fā)表在生物信息學(xué)期刊上。

本文引用地址:http://m.butianyuan.cn/article/201811/395085.htm

  全球癌癥研究在全球范圍內(nèi)吸引了大量資金,科學(xué)文獻(xiàn)現(xiàn)在如此巨大,以至于研究人員正在努力跟上它:現(xiàn)在,關(guān)鍵假設(shè)產(chǎn)生的證據(jù)在出版后很久就被發(fā)現(xiàn)。

  癌癥是一類復(fù)雜的疾病,尚未完全了解,是全球第二大死因。癌癥發(fā)展涉及眾多化學(xué)和生物化學(xué)分子,反應(yīng)和途徑的變化,并且正在各種科學(xué)領(lǐng)域進(jìn)行癌癥研究,這些領(lǐng)域在描述類似概念的方式上具有可變性。

  “作為一名癌癥研究員,即使你知道自己在尋找什么,每天也會有數(shù)千篇論文出現(xiàn),”劍橋語言技術(shù)實驗室聯(lián)合主任Anna Korhonen教授說道,他與LION LBD合作領(lǐng)導(dǎo)了這項研究。英國劍橋研究所癌癥研究所的Masashi Narita博士和瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院的Ulla Stenius教授?!癓ION LBD使用人工智能來幫助科學(xué)家及時了解他們所在領(lǐng)域的已發(fā)表的發(fā)現(xiàn),但也可以通過結(jié)合可能看似無關(guān)的來源之間的聯(lián)系來幫助他們結(jié)合文獻(xiàn)中已知的新發(fā)現(xiàn)?!?/p>

  LION LBD中的“LBD”代表基于文獻(xiàn)的發(fā)現(xiàn),這是20世紀(jì)80年代開發(fā)的一個概念,旨在通過梳理來自不連續(xù)來源的信息來進(jìn)行新的發(fā)現(xiàn)。原始版本的LBD背后的關(guān)鍵思想是,文獻(xiàn)中從未明確鏈接的概念可能通過中間概念間接聯(lián)系起來。

  LION LBD系統(tǒng)的設(shè)計允許實時搜索以發(fā)現(xiàn)數(shù)千萬個出版物的數(shù)據(jù)庫中的實體之間的間接關(guān)聯(lián),同時保留用戶在其原始上下文中探索每個提及的能力。

  “例如,您可能知道某種癌癥藥物會影響某種途徑的行為,但對于LION LBD,您可能會發(fā)現(xiàn)針對完全不同的疾病開發(fā)的藥物會影響相同的途徑,”Korhonen說。

  LION LBD是第一個專門針對癌癥研究需求而開發(fā)的系統(tǒng)。它特別關(guān)注癌癥的分子生物學(xué),并使用最先進(jìn)的機(jī)器學(xué)習(xí)和自然語言處理技術(shù),以檢測文本中癌癥標(biāo)志的參考。對系統(tǒng)的評估已經(jīng)證明了它能夠識別未發(fā)現(xiàn)的鏈接并在潛在的連接中高度排列相關(guān)概念。

  該系統(tǒng)使用開放數(shù)據(jù),開源和開放標(biāo)準(zhǔn)構(gòu)建,可作為基于Web的交互式界面或可編程API。

  研究人員目前正致力于擴(kuò)大LION-LBD的范圍,以包括更多的概念和關(guān)系。他們還與癌癥研究人員密切合作,為最終用戶提供幫助和改進(jìn)技術(shù)。

  該系統(tǒng)是與劍橋大學(xué)語言技術(shù)實驗室,英國劍橋研究所癌癥研究所和瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院合作開發(fā)的,由醫(yī)學(xué)研究委員會資助。



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